Калкулатор за молекулно тегло на протеин

Автор: Henrick Yau
- 30 септември 2026 г.
| |

Калкулатори

0
Валидно

Молекулното тегло на протеин се изчислява чрез сумата от средните изотопни маси на неговите аминокиселинни остатъци:

\[ MW = \sum (n_i \times MW_i) - (n_{пептид} \times MW_{H_2O}) \]

Където:

  • \(n_i\) = Брой на всяка аминокиселина в последователността
  • \(MW_i\) = Молекулно тегло на всяка аминокиселина
  • \(n_{пептид}\) = Общ брой пептидни връзки
  • \(MW_{H_2O}\) = Молекулно тегло на водна молекула (18.02 Da)

Какво е Калкулаторът за молекулно тегло на протеин?

Калкулаторът за молекулно тегло на протеин помага да се определи молекулното тегло на протеин въз основа на неговата аминокиселинна последователност или състав. Той също така изчислява допълнителни свойства като теоретична изоелектрична точка (pI), екстинкционен коефициент, хидрофобност (GRAVY резултат) и нетен заряд при pH 7.

Въвеждане на протеинова последователност или състав

Калкулаторът предлага няколко начина за въвеждане на протеинови данни:

  • Метод на последователността: Въведете протеиновата последователност, като използвате еднобуквени кодове за аминокиселини.
  • Метод на състава: Ръчно въведете броя на всяка аминокиселина.
  • Разширени опции: Приложете модификации като ацетилиране, дисулфидни връзки или терминални модификации.

Изчисляване на Da, kDa, pI, екстинкция и GRAVY

  • Изчислява молекулно тегло както в Далтони (Da), така и в килодалтони (kDa).
  • Определя теоретична pI въз основа на pKa стойностите на аминокиселините.
  • Изчислява екстинкционен коефициент за UV абсорбция при 280 nm.
  • Оценява хидрофобността чрез GRAVY резултата.
  • Отчита персонализирани модификации като фосфорилиране, метилиране и амидиране.

Защо молекулното тегло на протеина е важно?

Познаването на молекулното тегло на протеин е от решаващо значение за:

  • Електрофорезен анализ (SDS-PAGE, Western blotting).
  • Идентификация чрез масспектрометрия.
  • Пречистване на протеини и хроматография.
  • Структурни и функционални изследвания.

Въпроси за изчисляване на молекулно тегло

Как се изчислява теоретичната pI?

Изоелектричната точка (pI) е pH стойността, при която протеинът няма нетен заряд. Тя се изчислява с помощта на уравнението на Хендерсън-Хаселбах:

\[ pI = \frac{pKa_{пол} + pKa_{отр}}{2} \]

Какво е екстинкционният коефициент?

Екстинкционният коефициент се изчислява, като се използва броят на остатъците от триптофан (W), тирозин (Y) и цистин (C):

\[ \varepsilon = (n_W \times 5500) + (n_Y \times 1490) + (n_C \times 125) \]

Как калкулаторът обработва модификациите?

Калкулаторът ви позволява да приложите различни посттранслационни модификации, които се добавят или изваждат от молекулното тегло на протеина.

Какво е GRAVY резултатът?

Средната стойност на хидропатията (GRAVY) е мярка за хидрофобността на протеина. Тя се изчислява като:

\[ GRAVY = \frac{\sum (Хидропатия_{АК} \times n_{АК})}{Общ\ брой\ аминокиселини} \]

Защо водната молекула е включена в изчислението?

Всяко образуване на пептидна връзка води до загуба на една водна молекула, така че общата маса се коригира съответно.

Ценен инструмент за биохимия и молекулна биология

Калкулаторът за молекулно тегло на протеин е ценен инструмент за изследователи и студенти в областта на биохимията и молекулярната биология. Независимо дали анализирате протеинова структура, провеждате експерименти или интерпретирате резултати, този инструмент предоставя основни молекулни свойства бързо и точно.